申请理由可能包括法院的成员与当事人有利害关系、法院的成员存在偏见或偏向等。法院应当在合理的时间内作出决定，并书面通知双方当事人。需要注意的是，具体的整体回避程序可能会因国家、地区、法院的不同而有所差异。
当事人申请法院整体回避的处理程序如下：
1. 提交申请：当事人应向法院提交书面申请，说明理由和要求整个法院回避。
2. 申请理由：当事人应当提供充分的理由来支持其申请整个法院回避。申请理由可能包括法院的成员与当事人有利害关系、法院的成员存在偏见或偏向等。
3. 双方辩论：法院应当通知另一方当事人，并给予其机会进行辩论。对申请整体回避的理由进行辩论，双方可以提供证据和相关材料来支持其观点。
4. 法院决定：法院将根据双方的陈述和提供的证据，以及适用的法律规定，决定是否接受当事人的申请。法院应当在合理的时间内作出决定，并书面通知双方当事人。
5. 上诉：如果申请被驳回，当事人可以根据相关法律程序提起上诉，要求上级法院再审该申请。
需要注意的是，具体的整体回避程序可能会因国家、地区、法院的不同而有所差异。当事人应当咨询当地法律专业人士，了解适用的具体程序和法规。