纳税人发现多缴税款的，应向税务机关提交退税申请报告、税务登记证副本、领取并填写《退税申请表》。若符合免予申报条件的，则无需补税。持《报告表》到办税厅申报。税务办税员根据《报告表》，开具完税证或缴款书。以上程序要注意的是单位已经办理了税务登记证。另外，代扣代缴个人所得税，税务机关应支付手续费，比例为税款的2%以内。
退税怎么申请？
纳税人发现多缴税款的，应向税务机关提交退税申请报告、税务登记证副本、领取并填写《退税申请表》。税务机关检查发现的，纳税人应提交退税申请报告、税务登记证副本、稽查局的税务处理决定书或管理科、税务所出具的多交税款调查报告、领取并填写《退税申请表》，税务机关审核后，报县或市局局长批准，开具《收入退还书》，按退税程序办理退库手续。
退税详细申请步骤如下：
1、下载个人所得税 APP，打开APP后，可从以下入口进入年度汇算：首页常用业务—综合所得年度汇算。
2、首页我要办税—“税费申报”综合所得年度汇算。
3、进入申报界面后，填报方式有使用已申报数据填写和自行填写两种选择。
4、为了方便申报，推荐大家选择使用已申报数据填写，税务机关已按一定规则预填了部分申报数据，大家只需确认即可。
5、选择使用已申报数据填写—开始申报后，系统提示标准申报须知（使用已申报数据），点击“我已阅读并知晓”，开始年度汇算申报。
6、此处需要对个人基础信息、汇缴地、已缴税额进行确认。
7、确认预填的收入和扣除信息无误，可直接点击下一步。
8、数据系统将自动计算您本年度综合所得应补（退）税额。
9、确认结果后，点击提交申报即可。
如存在多预缴税款，可选择申请退税。点击申请退税后，纳税人需选择退税银行卡。如前期已添加过银行卡，系统将自动带出已填银行卡信息。您需新增，点击添加银行卡信息—确定。
如存在少预缴税款，则需要补税。如您综合所得年度汇算需要补税且不满足免予汇算条件，则需点击立即缴税， 选择相应的缴税方式完成支付即可。
若符合免予申报条件的，则无需补税。如您综合所得年度汇算需要补税但满足免予汇算条件，则在税款计算后，申报界面直接点击享受免申报即可，无需缴纳税款。
我现在要为公司员工代缴个人所得税，代缴程序是什么
1、计算税额。按规定计算应扣缴的个人所得税。（工资个人所得税起征点是2000元/月人），计算公式是税额=（工资—2000）*税率-速算扣除数（税率与扣除数请查《个人所得税法》，网上有）2、填申报表。到主管税务机关办税服务厅领取《代扣代缴税款报告（或申报）表》，填写相关内容（一式两份）：
（1）申报时间（每月7日前）
（2）税种名称（个人所得税）；
（3）税款所属时间（从工资中扣缴税款的时间段，如2008年11月1日-11月30日）；
（4）税款金额（所有员工个税的汇总数）；
（5）签名（办税员）、盖财务章.
3、纳税申报。持《报告表》到办税厅申报。税务办税员审核后，受理申报并签名，退回一份《报告表》给你保存。
4、开票缴税。税务办税员根据《报告表》，开具完税证或缴款书。前者要缴现金或刷卡，后者要到开户银行完成划款程序。
以上程序要注意的是单位已经办理了税务登记证。此外如果可以网上申报缴税，就更方便了，具体可以到主管税务机关咨询以下。另外，代扣代缴个人所得税，税务机关应支付手续费，比例为税款的2%以内。